1400-luvulla makasiinirakennuksen paikalle rakennettu Haapsalun Johanneksen kirkko erottuu muista pohjois-eteläsuuntaisen asentonsa johdosta. Kirkon sisustuksesta ehdottomasti mainitsemisen arvoisia yksityiskohtia ovat viisi metriä korkea kivialttari ja puinen saarnastuoli. Mielenkiintoista tietää: Johanneksen kirkko on toiminut virolaisen seurakunnan kirkkona, ja sen puistossa on tavallisten kaupunkilaisten hautoja. Johanneksen kirkon tornissa riippuva kello on yksi Viron vanhimmista ja Läänemaan vanhin. Johanneksen kirkkoon voi tutustua ulkoapäin vuoden ympäri. Kirkon sisätiloihin pääsee tutustumaan kirkkokalenterin mukaisina juhlapäivinä.